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Diplomarbeit: Semiautomatische Segmentierung dreidimensionaler Kortex-Regionen auf Basis der Hirnoberfläche

Ausschreibendes Institut: ZEA-2 - Systeme der Elektronik
Kennziffer: D064/2014, Ingenieurwissenschaften, Informatik, Physik, Mathematik

Der Schwerpunkt der Arbeiten der Arbeitsgruppe Multimodale Bildverarbeitung am Zentralinstitut für Elektronik liegt auf der Erforschung und Entwicklung geeigneter algorithmischer Ansätze zur Segmentierung dreidimensionaler Strukturen im individuellen Gehirn. Diese Arbeiten bilden eine wesentliche Voraussetzung für die strukturelle und funktionelle Analyse dieser Regionen im Rahmen neurowissenschaftlicher Forschung und klinischer Diagnostik und Therapie. Im Rahmen unserer Projekte (z.B. EU, BMBF) suchen wir daher motivierte Studenten zur Bearbeitung aktueller Themen der medizinischen Bildverarbeitung.


Aufgabengebiet

In der Arbeitsgruppe wurde ein Prototyp zur semiautomatischen Segmentierung von Kortexregionen auf Basis klassifizierter MRT-Bilddaten entwickelt. Der in der Entwicklungsumgebung MITK implementierte und mit einer Benutzeroberfläche versehene Prototyp ermöglicht die Bestimmung einer Regionengrenze auf der Kortexoberfläche mittels 3D Live-Wire-Verfahren sowie die Generierung einer kortikalen 3D-Region auf Basis hierauf aufbauender Bildverarbeitungsschritte.


Zur Weiterentwicklung und Optimierung dieses Prototypen sollen folgende Themenbereiche bearbeitet werden:

  • Entwicklung und Optimierung der Algorithmik zur Segmentierung auf Basis klassenspezifischer Operationen (Binärbildverarbeitung, komplexe morphologische Operationen, Interpolation, Tracing, Volume Growing)
  • Erweiterung der Methodik zur Segmentierung verschieden gelabelter Kortexregionen
  • Laufzeitoptimierung rechenzeitintensiver Schritte
  • Erweiterung und Optimierung der graphischen Benutzeroberfläche (GUI) für die Anwendung in der Medizin


Zur quantitativen Evaluation sollen Phantomdaten generiert werden, die typische Geometrien der zu segmentierenden 3D-Regionen vereinfacht nachbilden. Die Evaluation anhand von Phantomdaten und realem Bilddatenmaterial dient der Qualitätssicherung und ist ein wichtiger Schritt der wissenschaftlichen Bildverarbeitung.

Zu diesen Themen bieten wir Master- und Diplomarbeiten (Uni, TH und FH) an, die entsprechend der Vorkenntnisse und des angestrebten Abschlusses gestaltet werden können. Bewerber/innen sollten möglichst umfassende Programmierkenntnisse (C/C++, Linux) sowie Vorkenntnisse im Bereich der Bildverarbeitung besitzen. Erfahrungen mit den Software-Toolkits ITK,VTK, MITK und/oder QT sind hilfreich.

Studenten/innen der Ingenieurwissenschaften, Informatik, Physik, Mathematik oder verwandter Gebiete, die sich für dieses Aufgabengebiet begeistern können, eine systematische und selbständige Arbeitsweise bevorzugen und einschlägige Erfahrungen mitbringen, sind uns herzlich willkommen. Gerne werden wir Sie bei der Einarbeitung unterstützen.

Bewerbungen

Bei Interesse wenden Sie sich bitte an:

Dr.-Ing. Gudrun Wagenknecht
Zentralinstitut für Elektronik
Forschungszentrum Jülich GmbH
52425 Jülich

Tel. 02461 / 61 31 84
Fax 02461 / 61 39 90
e-mail: g.wagenknecht@fz-juelich.de


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