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Institut für Neurowissenschaften und Medizin
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Markus Axer

Dr. rer. nat. Markus Axer

Diplom-Physiker

ORCID: 0000-0001-5871-9331

Leiter der Arbeitsgruppe Faserbahnarchitektur

Mitglied des Wissenschaftlich-Technischer Rat (WTR)

Dozent an der Bergischen Universität Wuppertal (CSiS)

 

Forschungsschwerpunkte:

  • Neurowissenschaften
  • Neurobildgebung
  • Neuroinformatik
  • Bild- und Signalverarbeitung
  • 3D Gehirnrekonstruktion aus histologischen Schnittserien 

Methoden:

  • Bildgebung mit polarisiertem Licht, Polarized Light Imaging (Entwicklung von Polarisationsmikroskopen, Hochdurchsatz Bildgebung von histologischen Hirnschnitten, Prozessautomatisierung, Hirnpräparation)
  • High performance computing (Softwareparallelisierung unter CPU/GPU Einsatz, Workflow Implementierung)
  • Verarbeitung und Visualisierung von Mikroskopbildern: Segmentierung, Registrierung, Independent Component Analysis, Bildstitching
  • Simulation der Wechselwirkung von Licht mit Gehirngewebe und Simulation der Polarisationsmikroskopischen Messung (Geometrische Optik, Elektrodynamik)

Adresse

Institut für Neurowissenschaften und Medizin (INM-1)
Forschungszentrum Jülich
52425 Jülich

Kontakt

Telefon: +49 2461 61-6314
Fax: +49 2461 61-2820
E-Mail: m.axer@fz-juelich.de

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