Verstärken Sie uns zum nächstmöglichen Zeitpunkt als

Bioinformatiker:in - Systemische Mikrobiologie und Omics-Datenmanagement (w/m/d)

titel

Möchten Sie zu mikrobieller Bioinformatik und digitalem Forschungsdaten-Management für eine nachhaltige Bioökonomie beitragen? Dann arbeiten Sie mit uns im Themenbereich "Systemische Mikrobiologie" am Institut für Bio- und Geowissenschaften - Biotechnologie (IBG-1) als Bioinformatiker:in auf dem Gebiet der molekularen und angewandten Mikrobiologie rund um die Erforschung und Entwicklung mikrobieller Zellfabriken und Biokatalysatoren. Hauptziele sind ein systemisches molekulares Verständnis und die Entwicklung von Mikroben als Biokatalysatoren für die Produktion industriell relevanter Produkte aus erneuerbaren Kohlenstoffquellen unter Einsatz von Metabolic Engineering, synthetischer Biologie und Hochdurchsatz-Screening-Technologien. Bei diesen Forschungsarbeiten werden auch digitale Daten in den Bereichen Genomics, Transcriptomics, Proteomics, Metabolomics und Phenotyping von mikrobiellen Stämmen erzeugt. Tragen Sie bei uns dazu bei, die mikrobielle Bioinformatik und das Forschungsdaten-Management für eine wissensbasierte Bioökonomieforschung anzuwenden und weiterzuentwickeln.

Ausschreibender Bereich
IBG-1
Kennziffer
2024-311

Ihre Aufgaben:

Sie arbeiten direkt mit den Omics-datengenerierenden Experimentator:innen zusammen und analysieren je nach Projekt anfallende Daten aus den Bereichen Genomics (DNAseq, ChAPseq/ChIPseq), Transcriptomics, und Proteomics, sowie gegebenenfalls Metabolomics und Phenotyping von mikrobiellen Stämmen. Ebenso beraten und unterstützen Sie die Experimentatoren bei deren eigenen Datenanalysen und unterstützen gegebenenfalls bei der Nutzung von de.NBI/ELIXIER. Weiterhin unterstützen Sie, die verschiedenen Datenströme und Meta-Daten aus Experimenten, Analysen und Dokumentationen durch digitale Workflows möglichst vollständig zu erfassen und in zukunftsfähigen Daten-Infrastrukturen nach den FAIR-Prinzipien zu archivieren und zusammenzuführen. Darauf aufbauend sollen nach Möglichkeit auch KI-/ML-basierte Anwendungen zum Einsatz kommen.

Die Tätigkeit umfasst im Wesentlichen (je nach Qualifikation):

  • Enge Zusammenarbeit bei Omics-Daten-Analysen mit dem engagierten Fachpersonal aus dem wissenschaftlichen und technischen Bereich
  • Mithilfe bei der Verfassung von Projektberichten / Publikationen, Datenaufbereitung
  • Technische Betreuung und Unterstützung der Wissenschaftler:innen und Techniker:innen bei der Etablierung und Nutzung neuer Forschungsdaten-Workflows und –Infrastrukturen
  • Entwicklung, Aufbau und Dokumentation von spezifischen digitalen Workflows (Genomics, Transcriptomics, …) nach jeweiligen Anforderungen
  • Erstellung von Anleitungen für die Anwender:innen zur Nutzung digitaler Workflows und Forschungsdaten-Infrastrukturen
  • Integration bestehender Daten in neue Forschungsdaten-Infrastrukturen

Ihr Profil:

  • Bachelor, Master oder Promotion mit Schwerpunkt in der (Bio-) Informatik, (Bio-) Ingenieurwissenschaft, Biotechnologie oder vergleichbare Fachrichtung (z.B. Genomik oder Data Science)
  • Freude und Kompetenz zur Zusammenarbeit mit den Forschenden in der Praxis
  • Ausgeprägte Schreib- und Kommunikationsfähigkeiten
  • Großes Interesse an Biologie und molekularer Mikrobiologie
  • Zielstrebige und aufgabenorientierte Arbeitsweise
  • Sehr gute Kenntnisse in mindestens einer Skript/Programmiersprache/Entwicklungsumgebung (z.B. Python, Perl, Qt) und Datenverarbeitungssoftware (z.B. Excel, R packages)
  • Weitere Programmierkenntnisse und Erfahrungen mit Datenbanken, Webseiten und GitLab/GitHub sind von Vorteil
  • Erfahrungen mit KI-/ML-Anwendungen sind zudem von Vorteil
  • Effiziente und zuverlässige Arbeitsweise
  • Freude an der Zusammenarbeit in interdisziplinären Teams

Unser Angebot:

Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir unterstützen Sie in Ihrer Arbeit durch:

  • Umfassende Trainingsangebote und individuelle Möglichkeiten zur persönlichen und fachlichen Weiterentwicklung
  • Möglichkeit zur Entwicklung eines eigenen Erfahrungsprofils in dem Thema
  • Integration in ein weltweit führendes Forschungsinstitut auf dem Gebiet mit einem anregenden wissenschaftlichen Umfeld
  • Einen großen Forschungscampus im Grünen, der beste Möglichkeiten zur Vernetzung mit Kolleginnen und Kollegen sowie zum sportlichen Ausgleich neben der Arbeit bietet
  • Flexible Arbeitszeitmodelle, attraktive Gleitzeitgestaltung sowie eine Vollzeittätigkeit, die auch vollzeitnah ( https://go.fzj.de/vollzeitnah ) ausgeübt werden kann
  • Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z.B. tlw. im Homeoffice
  • 30 Tage Urlaub sowie eine attraktive Brückentagsregelung
  • Optimale Voraussetzungen zur Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienbewusste Unternehmenspolitik unterstützt durch unser Büro für Chancengleichheit https://go.fzj.de/VereinbarkeitvonBerufundFamilie


Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits

Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungsreiche Aufgabe in einem internationalen und interdisziplinären Arbeitsumfeld. Die Stelle ist ab sofort zu besetzen und befristet bis zum 31.12.2025. Vergütung und Sozialleistungen erfolgen in Abhängigkeit von den vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung im Bereich der Entgeltgruppe 10, 11 oder 13 nach dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst (TVöD-Bund).

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung bis zum 28.10.2024

Jetzt bewerben

Fragen zur Ausschreibung?

Kontaktieren Sie uns gerne über unser Kontaktformular
Bitte beachten Sie, dass aus technischen Gründen keine Bewerbungen per E-Mail angenommen werden können.

Hilfreiche Informationen zum Bewerbungs- und Auswahlprozess finden Sie hier. Zudem finden Sie Antworten auf häufig gestellte Fragen bei unseren FAQs.

Letzte Änderung: 30.09.2024