ELIXIR Germany
Seit 2016 ist Deutschland Mitglied der europäischen Forschungsinfrastruktur ELIXIR Europe (European Life Science Infrastructure for Biological Information). ELIXIR arbeitet nach dem Hub-and-Node-Prinzip und vereint bioinformatische Ressourcen und Expertisen aus den Bereichen Datenbanken, Software, Training, Cloud Computing aus ganz Europa. Für diese Bereiche erarbeiten ELIXIR-Expertengruppen Richtlinien zur Interoperabilität. Ziel ist es, den Zugang zu diesen lebenswissenschaftlichen Daten und Tools zu erleichtern, die Forschung zu fördern und den internationalen Austausch von Expertise zu unterstützen.
ELIXIR Germany wurde vom BMBF als nationaler Knoten eingerichtet, um zum Aufbau einer länderübergreifenden Bioinformatik-Infrastruktur beizutragen.
ELIXIR Germany spielt deshalb eine zentrale Rolle bei der Koordination und Bereitstellung von Bioinformatik-Diensten und -Ressourcen auf nationaler und internationaler Ebene. Diese ermöglichen es Forschenden, Daten leichter zu finden, zu analysieren und nach den FAIR-Prinzipien gemeinsam zu nutzen, Expertise auszutauschen und Best Practices in den Lebenswissenschaften zu etablieren.
Darüber hinaus werden die ELIXIR Core Data Resources BRENDA, SILVA und BacDive sowie die ELIXIR Recommended Interoperability Resource European Galaxy Server von den Netzwerkpartnern von ELIXIR Germany bereitgestellt und betrieben.
Der deutsche ELIXIR-Knoten wird von den Mitgliedern des Deutschen Netzwerks für Bioinformatik-Infrastruktur (de.NBI) mit dem übergeordneten Ziel betrieben, das nationale Serviceangebot mit den europäischen Partnern zu harmonisieren.
Die Abteilung „ELIXIR Germany“ im IBG-5
Die Abteilung ELIXIR Germany unterstützt den „Head of Node" bei der strategischen Weiterentwicklung des deutschen ELIXIR-Knotens und fungiert als zentrale Anlaufstelle für den ELIXIR Hub bei der Umsetzung internationaler ELIXIR-Projekte.
Sie spielt eine Schlüsselrolle in der Koordination und im Management der vielfältigen Aktivitäten und Initiativen innerhalb des ELIXIR Germany-Netzwerks. Dazu gehört die Organisation regelmäßiger Veranstaltungen, um den Wissensaustausch und die Zusammenarbeit innerhalb von ELIXIR Germany und der gesamten ELIXIR-Struktur zu fördern. Im Rahmen der Dienstleistungsangebote koordiniert die Abteilung ELIXIR Germany den deutschen Service Delivery Plan und überwacht den Mittelfluss im ELIXIR-Knoten. Zudem identifiziert und akquiriert sie Fördermittel und Zuschüsse zur Unterstützung von Forschungsprojekten und Initiativen.
Publikationen
- Harrow et al., ELIXIR: providing a sustainable infrastructure for life science data at European scale, Bioinformatics, 2021
- Ortseifen et al., Establishment of ELIXIR Germany national node and its contribution to COVID-19 research, F1000 Research, 2020.
- Wibberg et al., The de.NBI / ELIXIR-DE training platform - Bioinformatics training in Germany and across Europe within ELIXIR, F1000 Research, 2020.
- Belmann et al., de.NBI Cloud federation through ELIXIR AAI, 2019.
Kontakt
Dr. Irena Maus
Node Coordinator
ELIXIR Germany
Institut für Bio- und Geowissenschaften (IBG-5)
Forschungszentrum Jülich GmbH
c/o Centrum für Biotechnologie (CeBiTec)
Universität Bielefeld
33594 Bielefeld
ELIXIR Germany Heads of Node:
Prof. Dr. Oliver Kohlbacher, Universität Tübingen (oliver.kohlbacher@uni-tuebingen.de)
Prof. Dr. Alexander Sczyrba, Forschungszentrum Jülich (a.sczyrba@fz-juelich.de)