Modellierung und Simulation chemischer Sinneswahrnehmung
Über
Ziel unserer Forschungsgruppe ist es zu verstehen, wie chemische Verbindungen in Lebensmitteln im menschlichen Körper auf molekularer Ebene nachgewiesen werden und wie sich solche Wechselwirkungen auf die menschliche Gesundheit auswirken können. Diese Forschung erfolgt in Zusammenarbeit mit Ernesto Illy Foundation und illy caffè S.p.A (Triest, Italien).
Wir untersuchen auch Ionenkanäle und Transporter, die für die Informationsverarbeitung im Gehirn wichtig sind. Diese Forschung erfolgt in enger Zusammenarbeit mit unseren Kollegen am IBI-1 und IBI-7 und innerhalb der DFG-geförderten Forschergruppen FOR2518 und FOR5046.
Wir wenden eine breite Palette von Berechnungstechniken an, von der molekularen Modellierung bis hin zu Docking- und Molekulardynamiksimulationen, einschließlich hybrider/mehrskaliger Ansätze. Daher arbeiten wir eng mit unseren Kollegen am INM-9 zusammen, die die entsprechenden Codes and Webservers entwickeln.
Forschungsthemen
- Molekulare Modellierung
- Multiskalensimulationen
- Chemischer Sensor
- Transporter
- Ionenkanäle
Dmitrieva, N., Gholami, S., Alleva, C., Carloni, P., Alfonso-Prieto, M., Fahlke, Ch. (2024) EMBO J. 43, 6740-6765 (Link)
Maleeva, G., Nin-Hill, A., Wirth, U., Rustler, K., Ranucci, M., Opar, E., Rovira, C., Bregestovski, P., Zeilhofer, H. U. , König, B., Alfonso-Prieto, M., Gorostiza, P. (2024) J. Am. Chem. Soc. 146, 28822-28831 (Link)
Meyer, M., Jurek, B., Alfonso-Prieto, M., Ribeiro, R., Milenkovic, V. M., Winter, J., Hoffmann, P., Wetzel, C. H., Giorgetti, A., Carloni, P., Neumann, I. D. (2022) Mol. Psych. 27, 907–917 (Link)
Alfonso-Prieto, M. (2021) J. Membr. Biol. 254, 343-352 (Link)
Nin-Hill, A., Mueller, N. P. F., Molteni, C. , Rovira, C., Alfonso-Prieto, M. (2021) Intl. J. Mol. Sci. 22, 12072 (Link)
Chiariello, M. G., Alfonso-Prieto, M., Ippoliti, E., Fahlke, Ch., Carloni P. (2021) J. Phys. Chem. Lett. 12, 4415-4420 (Link)
Alfonso-Prieto, M., Biarnés, X., Vidossich, P., Rovira, C. (2009) J. Am. Chem. Soc., 131, 11751-11761 (Link)