Constraint Network Analysis (CNA)

Die Constraint Network Analysis [1] (CNAnalysis) ist ein auf der Graphentheorie basierender Ansatz zur Analyse der Steifigkeit, mit dem globale und lokale Flexibilitäts- und Steifigkeitseigenschaften von Proteinen durch thermische Entfaltungssimulationen analysiert werden. Der Ansatz wurde zur Vorhersage der Thermostabilität von Proteinen und zur Identifizierung von Rückständen verwendet, deren Mutation die Thermostabilität eines Proteins verbessern würde [2,4]. Darüber hinaus kann die CNA auch zur Untersuchung von Änderungen der biomolekularen Flexibilität aufgrund von Allosterie [3] und Komplexbildung eingesetzt werden.

Ein Webserver ist hier vorhanden.

[1] Pfleger et al. J. Chem. Inf. Model. (2013)

[2] Rathi PC et al. PLoS Comput Biol (2016)

[3] Pfleger et al. J. Chem. Theo. Comput. (2017)

[4] Nutschel et al. J. Chem. Inf. Model. (2020)