Hauptinhalt überspringenNavigation überspringenFooter überspringen
de en 
Website

Institut für Bio- und Geowissenschaften (IBG)

Bioinformatik (IBG-4)

  • Zur Übersicht Aktuelles

    • Meldungen
      • Termine
      • Zur Übersicht Forschung

        • Strukturbasierte Bioinformatik
          • ▾Modellierung von Membranproteinen mit bioökonomischen Auswirkungen
          • ▾Computergestützte Enzymtechnologie
          • ▾Computergestützte Biokatalyse der nächsten Generation
          • ▾Computergestützte pharmazeutische Chemie
        • Omics-/Datenbasierte Bioinformatik
          • ▾Omics- und Datenbasierte Bioinformatik
          • ▾Angewandtes maschinelles Lernen
          • ▾Datenbanken und Data Science
          • ▾Bioinformatik
          • ▾Quantitative Bioökonomie
        • Drittmittelprojekte
          • ▾Drittmittelprojekte im Bereich der Strukturbasierten Bioinformatik
          • ▾Drittmittelprojekte im Bereich Omics-/Datenbasierte Bioinformatik
      • Zur Übersicht Leistungen

        • Leistungen Omics-/Datenbasierte Bioinformatik
          • ▾MapMan | Visualize Plant Omics data
          • ▾Mercator | Classify and Annotate Plant Genomes
          • ▾Trimmomatic | Trimm and Preprocess NGS Data
          • ▾PlaBiPD
          • ▾GXP The Gene Expression Plotter
        • Leistungen Strukturbasierte Bioinformatik
          • ▾Constraint Network Analysis (CNA)
          • ▾VisualCNA
          • ▾RCNMA/NMSim
          • ▾DrugScore
          • ▾PACKMOL-memgen
          • ▾Free Energy Workflow (FEW)
          • ▾Vasor
          • ▾TopScore
          • ▾TopDomain
          • ▾TopProperty
          • ▾PocketAnalyzerPCA
      • Zur Übersicht Karriere

        • Unsere Stellenagebote
          • Bachelor-, Master- und Doktorarbeiten
          • Zur Übersicht Über uns

            • Organisation
              • Mitarbeiter
                • Kooperationen
                  • Kontakt & Besucherinfos
                  • Zur Übersicht Publikationen

                    • Publikationen 2023
                      • Publikationen 2022
                        • Publikationen 2021
                          • Publikationen 2020
                            • Publikationen am IBG-2 2019 - 2020
                              • ▾Publikationen am IBG-2 2020
                              • ▾Publikationen am IBG-2 2019
                            • Publikationen der NIC-Forschungsgruppe Computational Biophysical Chemistry
                            /
                            Leistungen
                            /
                            Leistungen Omics-/Datenbasierte Bioinformatik

                            Leistungen Omics-/Datenbasierte Bioinformatik

                            Die Arbeitsgruppe von Prof. B. Usadel hat mehrere Algorithmen und Software programmiert und veröffentlicht, die die Bearbeitung und Analyse von Sequenzierungen und die Auswertung und Interpretation von Sequenz- und Expressionsdaten ermöglichen und unterstützen. Weiterhin entwickelt, bearbeitet und pflegt das IBG-4 öffentliche Datenbanken.

                            a

                            Trimmomatic | Trimm and Preprocess NGS Data

                            Trimmomatic ist ein effizientes und flexibles Befehlszeilenprogramm, das eine Vielzahl von Korrekturen oder “trimming“-Aufgaben für Illumina paired-end und single-end Daten durchführt und nachgelagerte Verarbeitungsschritte erheblich verbessert.

                            a

                            Mercator | Classify and Annotate Plant Genomes

                            Die Mercator-Pipeline weist Protein- oder Nukleotidsequenzen aus Sequenzierungen automatisch Genfunktionen zu. Dabei nutzt Mercator die „BIN“-Ontologie von MapMan.

                            a

                            MapMan | Visualize Plant Omics data

                            MapMan visualisiert Daten aus Genexpressionsanalysen, hier werden Gene oder Proteine mit gemeinsamer Funktion in z.B. einen Biosyntheseweg gemeinsam dargestellt.

                            a

                            PlaBiPD

                            PlaBiPD ist eine umfassende Plattform für Genome von Nutzpflanzen.

                            a

                            GXP The Gene Expression Plotter

                            GXP ist ein Tool für die Visualisierung und Analyse von RNA-Seq- und Metabolomics-Daten. Es läuft vollständig im Webbrowser des Benutzers.

                            Letzte Änderung: 17.08.2023
                            Jülich Blogs

                            Forschungszentrum Jülich GmbH

                            Wilhelm-Johnen-Straße52428 Jülich
                            02461 61-0
                            02461 61-8100
                            Anfahrt

                            Jülich News

                            Das monatliche Update aus dem Forschungszentrum

                            © Forschungszentrum Jülich
                            • Impressum
                            • Data Protection
                            • Barrierefreiheit