DrugScore
Zu den einschlägigen wissensbasierten Scoring-Funktionen, die in unserer Gruppe entwickelt wurden, gehören: DrugScoreRNA, DrugScore2018 und DrugScorePPI. Diese Funktionen, die von aus der PDB abgeleiteten statistischen Potenzialen abgeleitet und durch einen atomtypbasierten QSAR-Ansatz feinabgestimmt wurden, können zur Vorhersage und Quantifizierung von RNA-Liganden- (DrugScoreRNA) und Protein-Liganden- (DrugScore2018) sowie Protein-Protein-Wechselwirkungen (DrugscorePPI) verwendet werden. DrugscorePPI ist eine Scoring-Funktion für das computergestützte Alanin-Scanning in Protein-Protein-Grenzflächen und kann zur Identifizierung von Hot Spots in Protein-Protein-Grenzflächen verwendet werden.
Ein Webserver zu DrugScorePPI ist vorhanden.
Pfeffer & Gohlke J. Chem. Inf. Model. (2007)
Dittrich et al. J. Chem. Inf. Model. (2019)
Krüger & Gohlke Nucleic Acids Research (2010)