TopEnzyme
Wir verwenden 3D Graph Convolutional Neural Networks, um die Klassifizierung von Proteinfunktionen auf der Grundlage von lokalisierten 3D-Protein-Deskriptoren zu verbessern. Diese neue Methode führte zur Entwicklung von TopEC, einem neuen Enzymklassifizierungssystem, das eindeutige strukturelle und topologische Daten von Enzymen mit gegebenen EC-Nummern und repräsentativen 3D-Strukturen in AlphaFoldDB oder SWISS-MODEL verknüpft. TopEC basiert auf TopEnzyme, einer kuratierten, nicht redundanten Enzymstrukturdatenbank, die zum Trainieren dieser Methode aufgebaut wurde.
![Improving enzyme classification using deep-learning](/en/ibg/ibg-4/research/research-projects/projects-gohlke-group/top-enzyme/topenzyme_db.png/@@images/image/great)
Kontakt: Prof. Holger Gohlke / Karel Van der Weg
Gefördet durch die Helmholtz School for Data Science in Life, Earth and Energy
Letzte Änderung: 01.02.2023