Auch in diesem Bachelorkurs werden wieder interessante Projekte von den Studierenden des 3. Semesters bearbeitet. Diese Aufgabe soll die Azubis in die Lage versetzen, ein überschaubares Software-Projekt in all seinen Phasen selbständig durchzuführen. Die Software-Projekt-Themen wurden von Mitarbeitern aus unterschiedlichen Instituten des Forschungszentrums gestellt. Dabei geht es nicht nur um die optimale softwaretechnische Lösung. Man muss sich im Team auf ein Konzept einigen, sich absprechen, funktionierende Schnittstellen zu den einzelnen Softwarekomponenten festlegen und nicht zuletzt ein informatives Poster erstellen. Präsentation der Ergebnisse am 4. März 2026, 12 - 15 Uhr, Seminarraum, JSC
Betreuende bzw. Ausbildende, MaTSE aller Jahrgänge und interessierte Mitarbeiter sind herzlich willkommen. Die Studierenden freuen sich auf zahlreiche Besucher. An den einzelnen Ständen können Lösungsansätze und verwendete Techniken diskutiert, Poster begutachtet und fachkundig erläutert werden. Praktisch wird jedes Projekt an Rechnern demonstriert und die Ergebnisse verständlich interpretiert.
Für die Studierenden ist es ein sehr aufregender Nachmittag und das Publikum darf mal wieder einen tiefen Einblick in die Arbeitswelt unserer MaTSE geniessen. Wir vom MaTSE-Team freuen uns schon auf die Projekte und wünschen unseren Studiernden viel Erfolg.
Themen / AUfgabenstellungen 2026
Weiterentwicklung des Export Tools bezüglich der Anzeige von graphischen Analysen für das IBG-2 interne Phenomis-System
Das IBG-2 nutzt eine zentrale Datenbank zur Verwaltung von Pflanzendaten (Art,Genotyp,Aussädatum, ...). Neben dieser zentralen Datenbank besitzen die einzelnen Messsysteme eigene Datenbanken in welchen die Messdaten erfasst werden. Hierfür wurde im letzten Jahr ein Export-Tool entwickelt, welches über eine generische Schnittstelle die Messdaten der Einzelsystem abrufen und exportieren kann. Damit die Anwender ohne Export und weitere Analyse bereits während laufender Versuche einen ersten Eindruck der Daten bekommen können, soll das Tool um grundlegende graphische Darstellungen der Messdaten erweitert werden. Der Anwender sollte hierfür aus den verfügbaren Daten wählen, welche Messgrößen grafisch dargestellt werden sollen. Zusätzlich sollte wählbar sein, welche Art von Darstellung (Zeitreihe, Korrelationen, ...) gewünscht ist. Erste (minimale) Statistiken (Stdabw., ...) könnten ebenfalls direkt mit eingebunden werden. Anforderungen: - Analyse der zur Verfügung stehenden Daten - Auswahl geeigneter Plot Libraries - Auswahl geeigneter Plots für 2D/3D Datensätze - Darstellung von mehrdimensionalen Daten
Automatisierte Newsletter-Erstellung
Im PGI-4 gibt es alle zwei Wochen einen Newsletter an alle Mitarbeitenden des Instituts. Dieser wird von der Administration händisch erstellt, jedoch enthält er viele Elemente, die man automatisiert einfügen kann. Somit kam der Wunsch auf, dass eine Vorlage automatisch erstellt wird und nur Einzelheiten per Hand nachgepflegt werden. Automatisch erstellt werden können hierbei zum Beispiel: - Anpassung der aktuellen Kalenderwochen (Gültigkeitszeitraum des Newsletters), sowie des Datums - Einbindung aktueller Rundschreiben (Auslesen von der Intranetseite, Einbindung mittels Links) - Vortragsthemen der nächsten 2 Wochen (diese können aus dem Wiki ausgelesen werden) - ggf. Einbindung / Screenshots von Social Media Beiträgen (LinkedIn, Mastodon, Threads) Der genaue Aufbau (gemäß aktueller Outlookvorlage) und die Visualisierung des Newsletters wird den Studierenden zur Verfügung gestellt. Die Kommunikation erfolgt nach aktuellem Stand direkt mit der Administration und Social Media Beauftragten bzgl der Visualisierung und genauen Anforderungen, wird aber softwareseitig zusätzlich entsprechend betreut.
Integration von Git-Issues und Merge-Requests in das Kanban-Tool Wekan zur Projektorganisation
Im Rahmen des Projekts soll eine Schnittstelle zwischen Gitlab/Jugit und Wekan erstellt werden. Wekan ist eine Self-hosted Lösung für Kanban Boards. Die Git Issues sollen dabei als Karten auf verschiedenen Kanbanboards abgebildet werden. Dazu soll in einem konfigurierbaren Zeitintervall (z.B. 300 s) die Gitlab-API für Issues in definierten Projekten angefragt werden und diese in Wekan angelegt bzw. aktualisiert werden.
Technische Details: Pro Gitprojekt soll ein Kanban-Board angelegt werden. In der Grundkonfiguration der Anwendung werden Standardspalten (z.B. ToDo, Doing, Done) festgelegt, zusammen mit dem Pollingintervall und den Accesstokens für die Gitprojekte (Beispiel am Ende). Ein Gitlab-Issue wird in einer einzelnen Karte dargestellt. Titel, Beschreibung, Fälligkeitsdatum und Labels der Gitlab-Issues sollen dabei in der Karte übernommen werden. Auf Basis von Issue-Labels sollen die Karten den Standardspalten (s.o.) zugeordnet werden. Die Zuordnung zwischen Issue-Label und Spalte wird in der Grundkonfiguration festgelegt.
Bei jedem Pollingzyklus sollen die bestehenden Karten überprüft werden und entsprechend potentiell geänderter Issue-Labels zwischen den Spalten bewegt werden. Da sich Titel, Beschreibung und Labels des Issues verändern können soll am Besten die URL zur Zuordnung zwischen Karten und Issues genutzt werden.
Implementierung: Die Implementierung soll in Python 3.12 stattfinden. Es ist zu bewerten ob bestehende API-Bibliotheken für Wekan und Gitlab in Python sinnvoll sind. Die Konfiguration der Anwendung erfolgt in einer YAML-Datei (oder vergleichbaren Formaten). Der Git Accesstoken für die entsprechenden Git-Projekte ist mit minimaler Permission zu wählen. Beispielkonfiguration: config.yaml: polling_interval: 300
standard_columns:
# Wekan-Spalte: "Issue-Label" Abandoned: "state:abandoned" Blocked: "state:blocked" Doing: "state:doing" On-Hold: "state:on-hold" Planning: "state:planning" Doing: "state:doing" Review: "state:review" Testing: "state:testing" Todo: "state:todo" gitlab_projects: # Gitlab project ID: "project access token" 12376: "glp-xxxxxx" 23511: "glp-xxxxxx"
Erstellung eines Webportals zur Deep-Zoom-Image Generierung aus großen Bildern für die Darstellung mit OpenSeadragon
Motivation Die Visualisierung sehr großer Bilder (z. B. hochauflösende Karten, Mikroskopaufnahmen, Satellitenbilder) stellt besondere Anforderungen an Webanwendungen. Klassische Bildformate stoßen bei der interaktiven Betrachtung schnell an ihre Grenzen.
OpenSeadragon ist eine JavaScript-Bibliothek, die es ermöglicht, Deep-Zoom-Bilder (DZI – Deep Zoom Image) effizient in Webseiten darzustellen. Dabei werden große Bilder in viele kleine Kacheln zerlegt, die je nach Zoomstufe nachgeladen werden.
Zielsetzung Ziel dieses Projekts ist die Entwicklung eines Webportals, das es Anwendern ermöglicht, sehr große Bilddateien hochzuladen und automatisch in ein Format zu konvertieren, das mit OpenSeadragon kompatibel ist.
Das zu entwickelnde Portal soll den gesamten Prozess vom Upload eines Bildes über die serverseitige Verarbeitung (Erzeugung von Deep-Zoom-Kacheln im DZI-Format) bis hin zur Bereitstellung einer öffentlichen URL abbilden. Diese URL kann anschließend in Webseiten eingebettet werden, um die Bilder direkt über OpenSeadragon zu visualisieren.
Zur Verdeutlichung zeigt die folgende Übersicht den Zusammenhang der beteiligten Komponenten:
Aufgabenstellung Entwickeln Sie ein Webportal mit den folgenden Funktionalitäten: • Upload großer Bilder o Nutzer sollen Bilder über eine Weboberfläche hochladen können. o Unterstützte Formate: PNG, JPEG, TIFF (optional: weitere Formate). • Serverseitige Verarbeitung o Nach dem Upload soll das Bild automatisch in das DZI-Format konvertiert werden. ▪ Als mögliches Tool zur Konvertierung kann VIPS (https://www.libvips.org) oder deepzoom https://github.com/openzoom/deepzoom.py) genutzt werden. o Die Kacheln sollen auf dem Server gespeichert werden. o Es soll eine eindeutige URL für jedes generierte DZI-Bild vergeben werden. • Vorschau im Portal o Das Portal soll nach der Verarbeitung eine Vorschau des Deep-Zoom-Bildes (mittels OpenSeadragon) direkt im Browser anzeigen. • Automatische Snippet-Erstellung o Das Portal soll ein HTML/JS-Snippet generieren, das der Nutzer direkt in seine eigene Webseite einfügen kann. • Benutzerfreundlichkeit o Intuitive Weboberfläche. o Fehlerbehandlung bei ungültigen Formaten oder zu großen Dateien. Erweiterungsmöglichkeiten • Entwicklung eines REST-APIs für den Upload von Bildern • Fortschrittliches Frontend mit Drag & Drop Upload • Benutzerverwaltung und Authentifizierungo Unterstützung für anwender-spezifisches Verwalten der Bilddaten • Ausbauen zu einem allgemeinen FZJ-Service für jeden FZJ-Mitarbeiter Links • OpenSeadragon - https://openseadragon.github.io o Anwendungsbeispiele - https://openseadragon.github.io/examples/in-the-wild • Beispiel eines ähnlichen Webservice - https://srv2.zoomable.ca/upload_new.php • DZI-Generators o https://www.libvips.org o https://github.com/openzoom/deepzoom.py
