Neuroinformatik

Aufgrund der immensen Datengrößen ist es nicht möglich, alle von uns erzeugten 3D-Modelle, Gehirnkarten und zugehörigen Datensätze offline auf einem herkömmlichen Computer zu nutzen. Stattdessen sind Cloud-Technologien für Remote-Visualisierung, Annotation, und benutzerdefinierte Zugriffe erforderlich. Dafür entwickeln und pflegen wir Softwarebibliotheken und Webdienste, mit denen sich neurowissenschaftliche Daten und Gehirnatlanten webbasiert nutzen und analysieren lassen. Als Teil des EBRAINS Konsortiums bieten wir der neurowissenschaftlichen Community technische Beratung an – insbesondere bei der Einführung geeigneter offener Standards für Forschungs- und Metadaten.

​Siibra – Interacting with brain atlases

siibra ist eine Software-Sammlung für frei zugängliche Gehirnatlanten. Sie verbindet multimodale Datensätze unterschiedlicher Bildgebungsverfahren mit anatomischen Strukturen in Referenzräumen – über verschiedene räumliche Maßstäbe hinweg. Die Software-Sammlung ist sowohl für die interaktive Erkundung über einen 3D-Webviewer (siibra-explorer) ausgelegt als auch für die Einbindung in Analyse- und Simulationsabläufe über eine umfassende Python-Bibliothek (siibra-python).