JuBrain Anatomy Toolbox

Die JuBrain Anatomy Toolbox (alias SPM Anatomy Toolbox) ist ein SPM-Plugin mit probabilistischen zytoarchitektonischen Karten zur Kombination mit funktionellen Neuroimaging-Daten.

Download

JuBrain Anatomy Toolbox (zip-Archiv)
JuBrain Anatomy Toolbox (GitHub Projekt)
Aktuelle Version: 3.0
Bedienungsanleitung

Das Urheberrecht und alle anderen Rechte an den hiermit bereitgestellten Produkten liegen bei der Forschungszentrum Jülich GmbH. Die Nutzung der Produkte ist nur für eigene pädagogische, wissenschaftliche oder private Zwecke gestattet. Die Herkunft der Produkte muss korrekt angegeben werden. Es ist nicht gestattet, die bereitgestellten Produkte zu überarbeiten, zu verändern oder nur Teile daraus zu extrahieren, z. der Brain Maps ohne ausdrückliche Genehmigung der Forschungszentrum Jülich GmbH. Ebenso ist es nicht gestattet, Unterlizenzen an Dritte zu vergeben.

Referenzen und Kontakt

Bei Fragen und Kommentaren zur JuBrain Anatomy Toolbox wenden Sie sich bitte an:
Prof. Simon Eickhoff

Bei allgemeinen Fragen und Kommentaren zur zytoarchitektonischen Kartierung wenden Sie sich bitte an
Prof. Katrin Amunts

Referenzen für die JuBrain Anatomy Toolbox:

Eickhoff S, Stephan KE, Mohlberg H, Grefkes C, Fink GR, Amunts K, Zilles K: A new SPM toolbox for combining probabilistic cytoarchitectonic maps and functional imaging data. NeuroImage 25(4), 1325-1335, 2005

Eickhoff, S.B.; Heim, S.; Zilles, K.; Amunts, K.: Testing anatomically specified hypotheses in functional imaging using cytoarchitectonic maps. NeuroImage 32(2), 570-582, 2006

Eickhoff SB, Paus T, Caspers S, Grosbras MH, Evans A, Zilles K, Amunts K Assignment of functional activations to probabilistic cytoarchitectonic areas revisited. NeuroImage 36(3), 511-521, 2007

Referenzen für probabilistische zytoarchitektonische Abbildungen

Zilles K, Amunts K (2010) Centenary of Brodmann’s map – conception and fate. Nature Reviews Neuroscience 11(2): 139-145

Amunts K, Schleicher A, Zilles K (2007) Cytoarchitecture of the cerebral cortex – more than localization. Neuroimage 37: 1061-1065

Zilles K, Schleicher A, Palomero-Gallagher N, Amunts K (2002) Quantitative analysis of cyto- and receptor architecture of the human brain. In: /Brain Mapping: The Methods/, J. C. Mazziotta and A. Toga (eds.), USA: Elsevier, 2002, p. 573-602.

Referenzen für die folgenden Bereiche werden mit der aktuellen Version verteilt

Amygdala (superficial, latero-basal and centro-medial complex)
• Amunts,K. et al., (2005). Anat. Embryol. (Berl) 210, 343-352.

Hippocampus
• Amunts,K. et al., (2005). Anat. Embryol. (Berl) 210, 343-352.

Superior Parietal Cortex (Areas 5L, 5M, 5Ci, 7A, 7PC, 7M, 7P)
• Scheperjans et al. (2008a), Cereb. Cortex 18: 846-867
• Scheperjans et al. (2008b), Cereb. Cortex 18: 2141-2157

Inferior Parietal Cortex (Areas PFop, PFt, PF, PFm, PFcm, PGa, PGp)
• Caspers et al. (2006), NeuroImage 33, 430-448
• Caspers et al. (2008), Brain Struct. Funct. 212, 481-495

Intraparietal Sulcus (Areas hIP1, hIP2, hIP3)
•Choi et al. (2006), J. Comp. Neurol. 495, 53-69
•Scheperjans et al. (2008a), Cereb. Cortex 18: 846-867
•Scheperjans et al. (2008b), Cereb. Cortex 18: 2141-2157

BA 17 and BA 18 (V1 / V2)
• Amunts,K et al., (2000). Neuroimage. 11, 66-84.

Broca’s region (Area 44 / Area 45)
• Amunts,K. et al., (1999). J. Comp Neurol. 412, 319-341.
• Amunts,K. et al., (2004). NeuroImage 22, 42-56.

Frontal pole (Areas Fp1 and Fp2)
• Bludau et al., (2013). Neuroimage. 2, 260-275.

Medial orbitofrontal cortex (Areas Fo1 – Fo5)
• Henssen et al., (2015). Cortex. 75, 87-112.

Anterior cingulate cortex (Areas 25, 33, P24a, P24b, P24c, P32, S24 and S32)
• Palomero-Gallagher et al., (2008). J Comp Neurol. 508(6), 906-926.

Fiber tracts
• Burgel,U. et al., (2006). Neuroimage 29, 1092-1105.
• Burgel,U. et al., (1999) Neuroimage. 10(5), 489-99.

Parietal operculum / SII (Areas OP 1 – OP 4)
• Eickhoff,S.B et al., (2006). Cereb. Cortex 16, 254-267.
• Eickhoff,S.B et al., (2006). Cereb. Cortex 16, 268-279.

Premotor cortex (Area 6)
• Geyer,S. (2003). The Microstructural Border Between the Motor and the Cognitive Domain in the Human Cerebral Cortex (Wien: Springer).

Motor cortex (Areas 4a and 4p)
• Geyer,S. et al., (1996). Nature 382, 805-807.

Primary somatosensory cortex (Areas 3a, 3b, 1)
• Geyer,S. et al., (1999). Neuroimage. 10, 63-83.
• Geyer,S. et al., (2000). Neuroimage. 11, 684-696.

Primary somatosensory cortex (Areas 2)
• Grefkes,C. et al., (2001). Neuroimage. 14, 617-631.

hOC5 (V5 / MT+)
• Malikovic,A., et al., (2007). Cereb. Cortex 17, 562-574.

Primary auditory cortex (Areas TE 1.0, TE 1.1 and TE 1.2)
• Morosan,P. et al., (2001) Neuroimage 13, 684-701.

Posterior insula (Areas Ig1, Ig2, Id1)
• Kurth,F. et al., (2010) Cerebral Cortex 20(6): 1448-1461.

Ventral extrastriate cortex (V3v / V4)
• Rottschy,C., et al., (2007). Hum Brain Mapp. 28(10):1045-1059.

Dorsal extrastriate cortex (hOC3d / hOC4d)
• Kujovic et al., Brain Struct. Funct. 10.1007/s00429-012-0390-9, 2012.

Gyrus fusiformis (FG1, FG2)
• J. Caspers et al., Brain Struct. Funct., 10.1007/s00429-012-0411-8, 2012.

Mid-Fusiform Gyrus (Areas FG3 and FG4)
• Lorenz et al., (2015). Cereb Cortex. pii: bhv225

Lateral occipital cortex (extrastriate areas hOc4la and hOc4lp)
• Malikovic et al., (2016). Brain Struct Funct. 221(4), 1877-1897.

Frontal pole (Fp1, Fp2)
• S. Bludau et al., (2014) Neuroimage, 93(2), 260–275

Basal Forebrain (Ch1-3, Ch4)
• L. Zaborszky et al., (2008) Neuroimage, 42(3), 1127–1141

Cerebellar nuclei (DDN, VDN, EN, GN, FN)
• Tellmann et al., (2015). Front Neuroanat. 13, 9-54.

Die JuBrain Anatomy Toolbox enthält auch den Cerebellar-Atlas von Diedrichsen

Cerebellar atlas Diedrichsen,J. et al., (2009) Neuroimage. 46(1), 39-46.
http://www.icn.ucl.ac.uk/motorcontrol/imaging/propatlas.htm

Die JuBrain Anatomy Toolbox enthält auch den Thalamic Connectivity Atlas von Behrens

Behrens TE et al., (2003) Nat Neurosci. 6(7):750-7.
http://www.fmrib.ox.ac.uk/connect/

Letzte Änderung: 13.12.2022