MapMan

Die Gruppe kuratiert MapMan-Kategorien und stellt manuell kuratierte Daten für die Annotation von Pflanzengenfamilien bereit, wobei der Schwerpunkt auf der Genfunktion liegt.

Diese Software (MapMan) kann für Modell- und Nutzpflanzenarten heruntergeladen werden (downloadable software MapMan) , aber wir verwenden auch ein automatisches Klassifizierungs- und genomweites Tool zur funktionellen Annotation von Proteinen und Genen (Mercator and Mercator 4).

Die Daten können dann direkt im MapMan-Tool oder als Ressource für die Genomannotation verwendet werden. Insbesondere die neue Version ist ultraschnell und ermöglicht die Annotation eines vollständigen Proteoms einer Pflanze in weniger als 10 Minuten. Dies ist eine de.NBI Ressource (www.denbi.de).

Expressionsdaten, die dem N-Glykosylierungsweg von Proteinen zugeordnet sind

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Prof. Björn Usadel

Letzte Änderung: 02.01.2023