Postdoc – High-Performance Computing & Foundation Models für die Biomedizin (w/m/d)

Ihre Aufgaben:

In dieser Position arbeiten Sie in einem interdisziplinären Team aus HPC-, ML- und Biomedizin-Expert:innen. Sie bringen Ihre individuellen Stärken ein und entwickeln sich in benachbarten Feldern weiter. Abhängig von Ihrem Profil können Sie Schwerpunkte setzen – z. B. auf skalierbares Training, Daten-/Feature-Pipelines oder modellseitige Weiterentwicklung – und dabei eng mit Helmholtz Munich, MDC Berlin und NVIDIA zusammenarbeiten.

Sie werden

• großskalige Trainings- und Inferenzläufe für Foundation Models auf JUPITER aufsetzen und optimieren (Multi-GPU/-Node, Mixed Precision, Parallelisierung, I/O-Optimierung)
  
• multimodale Datenquellen (z. B. scRNA-seq, ATAC-seq, Spatial Transcriptomics,.. ) in die Modellierung integrieren und leistungsfähige Daten-/Trainingspipelines entwickeln
  
• Anwendungsfälle mit Helmholtz Munich, MDC Berlin und NVIDIA vorantreiben – etwa Krankheitsmodellierung, Vorhersage von Zellzuständen oder Patient:innenstratifizierung
  
• zur Weiterentwicklung der Modellarchitekturen (z. B. Transformer, multimodale Fusion, generative Modelle) beitragen
  
• Ergebnisse auf Konferenzen präsentieren und in peer-reviewten Journals veröffentlichen

Ihr Profil:

• Wissenschaftliches Hochschulstudium (Master), vorzugsweise mit anschließender Promotion (PhD) in Informatik, Naturwissenschaften, Mathematik o. ä. mit sehr guter wissenschaftlicher Qualifikation, dokumentiert durch Publikationen in einschlägigen Fachjournalen; ausgeprägter quantitativer/statistischer Hintergrund (z. B. Wahrscheinlichkeitstheorie, lineare Algebra, Optimierung)
  
• Starke Expertise in mindestens einem der folgenden Bereiche und Bereitschaft, die übrigen im Team zu vertiefen: Hochleistungsrechnen (verteilte Systeme, Profiling, Performance-Optimierung), Training großer KI-Modelle (PyTorch/JAX/TensorFlow, Parallelisierung, Mixed Precision), Datenanalyse/Statistik (Experimentdesign, Auswertung, Unsicherheitsquantifizierung)
  
• Sehr gute Programmierkenntnisse in Python (C/C++ von Vorteil); Erfahrung mit HPC-Umgebungen (z. B. SLURM) ist willkommen
  
• Interesse an biologischen Fragestellungen und Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit
  
• Sehr gute Englischkenntnisse; Deutschkenntnisse sind ein Plus
  
• Wünschenswert wären Erfahrung mit multimodalen Omics-Daten (z. B. scRNA-seq, ATAC-seq, Spatial Transcriptomics, CITE-seq) oder medizinischen Bilddaten (H&E)
  
• Ebenfalls wünschenswert wären Beiträge zu Open-Source-Projekten, Benchmarks oder Repro-Pipelines

Unser Angebot:

Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Sie erwartet ein vielseitiges Angebot:

• WISSEN & WEITERBILDUNG: Umfassende Trainingsangebote und individuelle Möglichkeiten zur persönlichen und fachlichen Weiterentwicklung
  
• GESUNDHEIT & WOHLBEFINDEN: Ihre Gesundheit liegt uns am Herzen. Freuen Sie sich auf ein umfangreiches betriebliches Gesundheitsmanagement mit vielfältigen Angeboten – z. B. durch Beachvolleyball-Platz, Laufgruppen, Yoga-Kurse und vieles mehr. Zusätzlich stehen Ihnen unser betriebsärztlicher Dienst sowie ein erfahrenes Team der Sozialberatung direkt vor Ort zur Seite
  
• WORK-LIFE-BALANCE: Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten ist grundsätzlich nach Abstimmung und im Einklang mit den anstehenden Aufgaben und (Vorort-)Terminen gegeben
  
• FLEXIBILITÄT: Flexible Arbeitszeitmodelle inklusive vollzeitnaher Optionen ermöglichen eine individuelle Gestaltung Ihrer Arbeitszeit. Mehr dazu unter: https://go.fzj.de/vollzeitnah
  
• URLAUB: Sie erhalten bei uns 30 Tage Urlaub plus freie Brückentage (z.B. zwischen Weihnachten & Neujahr)
  
• FAIRE VERGÜTUNG: In Abhängigkeit von Ihren vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung erfolgt eine Eingruppierung im Bereich der Entgeltgruppe 13 TVöD-Bund. Alle Informationen zum Tarifvertrag des TVöD-Bund finden Sie auf der Seite des BMI: https://go.fzj.de/bmi.tvoed Die monatlichen Entgelte in Euro finden Sie gebündelt hier: https://go.fzj.de/bmi.tvoed.entgelt
  

Die Position ist auf 2 Jahre befristet. Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.

Weitere Informationen zu Vielfalt und Chancengerechtigkeit: https://go.fzj.de/diversitaet sowie zur gezielten Förderung von Frauen: https://go.fzj.de/job-journey-women